Melanotan-II ha una scarsa solubilità in acqua ma mostra una buona solubilità in solventi organici come dimetilsolfossido (DMSO) e N,N-dimetilformammide (DMF).

Nelle applicazioni pratiche, se è necessaria la dissoluzione per scopi sperimentali o terapeutici, è possibile prima scioglierla in DMSO per preparare una soluzione madre ad alta-concentrazione e successivamente diluirla con un tampone appropriato (come soluzione salina fisiologica o soluzione salina tamponata con fosfato-). Tuttavia, è necessario prestare attenzione nel controllare la concentrazione finale di DMSO-mantenendola generalmente al di sotto dello 0,1%-per evitare effetti tossici sulle cellule o sull'organismo.

Nel campo dell'estetica, Melanotan-II ha attirato l'attenzione diffusa grazie alla sua capacità di indurre la produzione di melanina e scurire la pelle. Numerosi studi si sono concentrati sulla valutazione della sua efficacia e sicurezza per quanto riguarda la protezione solare e l'uso cosmetico.